LAMMPS es un código clásico de dinámica molecular y un acrónimo de Simulador masivo paralelo atómico/molecular a gran escala. LAMMPS tiene potencial para el estado sólido materiales (metales, semiconductores) y materia blanda (biomoléculas, polímeros) y sistemas de grano grueso o mesoscópicos. Se puede utilizar para modelar átomos o, más genéricamente, como un simulador de partículas paralelas a escala atómica, meso o continua. LAMMPS se ejecuta en procesadores individuales o en paralelo mediante el paso de mensajes técnicas y una descomposición espacial del dominio de simulación. El código está diseñado para que sea fácil de modificar o ampliar con nuevas funciones.
LAMMPS está licenciado como open source, concretamente GPL 2.0. Mirar en referencias más abajo.
Para poder usar cryoDRGN una vez logueado en drago.csic.es tendrá que cargar los siguientes módulos en mismo orden.
module unuse /dragofs/sw/campus/0.2/modules/all/Core
module unuse /dragofs/sw/restricted/0.2/modules/all/Core
module load foss/2020a
module load LAMMPS
module unuse /dragofs/sw/campus/0.2/modules/all/Core
module unuse /dragofs/sw/restricted/0.2/modules/all/Core
module load fosscuda/2020b
module load LAMMPS
De cualquier forma podrá descargar scripts desde servicio Git del CSIC,en caso haber disponibles para este software, a continuación: