HTSeq es una herramienta para el análisis de datos de secuenciación de alto rendimiento. Procesa lecturas alineadas con HISTAT o STAR y asigna recuentos de valores de expresión. HTSeq también es adecuado para la cuantificación de datos de ARN-seq unicelulares (scRNA-seq). El paquete también incluye una herramienta htseq-count para preprocesar las lecturas de RNA-seq antes del análisis de expresión diferencial y una herramienta htseq-qa que evalúa la calidad de las lecturas.
Htseq está licenciado como GPL3. Mirar en referencias más abajo.
Para poder usar htseq una vez logueado en drago.csic.es tendrá que cargar los siguientes módulos en mismo orden.
module unuse /dragofs/sw/campus/0.2/modules/all/Core
module unuse /dragofs/sw/restricted/0.2/modules/all/Core
module load foss/2020
module load HTSeq/0.11.3